Estimados usuarios de las supercomputadoras de la UNAM,
Ha sido liberada la nueva versión la página de supercómputo en la UNAM: www.super.unam.mx
Seguirán encontrando manuales de aplicaciones, bibliotecas y guías de uso en la sección de manuales: www.super.unam.mx/manuales
Los avisos referentes a nuevas aplicaciones/bibliotecas disponibles, así como estados de operación de los equipos serán publicados en la sección de avisos:
www.super.unam.mx/avisos
Este blog será dado de baja en algunos días.
Agradeciendo su atención
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
miércoles, 16 de abril de 2008
lunes, 7 de abril de 2008
jobs perdidos, sábado 12 hrs
Estimados usuarios de la supercomputadora KanBalam,
por una falla en los nodos de servicio, el sábado 5 de abril a las 12:20 hrs, se perdió una buena parte de los jobs que a ese momento se encontraban corriendo y encolados en el equipo. Les pedimos reiniciar sus jobs, así como revisar que los que se encuentren corriendo estén en estado consistente.
Atentamente,
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
por una falla en los nodos de servicio, el sábado 5 de abril a las 12:20 hrs, se perdió una buena parte de los jobs que a ese momento se encontraban corriendo y encolados en el equipo. Les pedimos reiniciar sus jobs, así como revisar que los que se encuentren corriendo estén en estado consistente.
Atentamente,
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
viernes, 14 de marzo de 2008
mantenimiento en RedUNAM
Estimados usuarios de la supercomputadoras de la DGSCA,
durante la próxima semana, el personal de telecomunicaciones de la UNAM hará mantenimiento a la RedUNAM, por lo que el día 17 de marzo, entre las 17 y las 21 hrs es posible las conexiones a las supercomputadoras sean intermitentes.
Atentamente,
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
durante la próxima semana, el personal de telecomunicaciones de la UNAM hará mantenimiento a la RedUNAM, por lo que el día 17 de marzo, entre las 17 y las 21 hrs es posible las conexiones a las supercomputadoras sean intermitentes.
Atentamente,
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
jueves, 14 de febrero de 2008
Plan de Becarios de Cómputo de Alto Rendimiento
PROGRAMA DE BECAS DE CÓMPUTO DE ALTO RENDIMIENTO 2008
La Dirección General de Servicios de Cómputo Académico, a través de la Dirección de Cómputo para la Investigación
C O N V O C A
a los estudiantes de licenciatura de las áreas de ciencias, ingenierías e informática, a participar en el CONCURSO DE SELECCIÓN DE CANDIDATOS para su PROGRAMA DE BECAS 2008 en las áreas de: Administración de Supercómputo, Optimización, Realidad Virtual y Visualización Científica.
Objetivo
Formar recursos humanos con habilidades en técnicas y tecnologías de cómputo científico de alto rendimiento, con la finalidad de participar en actividades relacionadas con el uso de instrumentos de cómputo avanzados, como la Sala de Realidad Virtual Ixtli y la supercomputadora KanBalam.
Requisitos generales
• Alumno regular del 6to. al 10mo. semestres de la licenciatura o pasante.
• Promedio de 8.5.
• Comprensión de lectura en inglés.
• Disponibilidad de horario de 14:00 a 18:00 hrs. de lunes a viernes
• Conocimientos de nivel usuario de UNIX/Linux
Duración
El programa tiene una duración de un año; al término, se otorga Diploma de participación.
Registro en línea
http://becarios.computo-cientifico.unam.mx
Del 5 al 22 de febrero.
Examen de selección
25 de febrero.
PLATICAS INFORMATIVAS: 14, 18, 19 y 21 de febrero. 12:30 y 18:30 hrs.
En el Auditorio de la DGSCA
http://becarios.computo-cientifico.unam.mx
Inicio
• 24 de marzo de 2008.
La Dirección General de Servicios de Cómputo Académico, a través de la Dirección de Cómputo para la Investigación
C O N V O C A
a los estudiantes de licenciatura de las áreas de ciencias, ingenierías e informática, a participar en el CONCURSO DE SELECCIÓN DE CANDIDATOS para su PROGRAMA DE BECAS 2008 en las áreas de: Administración de Supercómputo, Optimización, Realidad Virtual y Visualización Científica.
Objetivo
Formar recursos humanos con habilidades en técnicas y tecnologías de cómputo científico de alto rendimiento, con la finalidad de participar en actividades relacionadas con el uso de instrumentos de cómputo avanzados, como la Sala de Realidad Virtual Ixtli y la supercomputadora KanBalam.
Requisitos generales
• Alumno regular del 6to. al 10mo. semestres de la licenciatura o pasante.
• Promedio de 8.5.
• Comprensión de lectura en inglés.
• Disponibilidad de horario de 14:00 a 18:00 hrs. de lunes a viernes
• Conocimientos de nivel usuario de UNIX/Linux
Duración
El programa tiene una duración de un año; al término, se otorga Diploma de participación.
Registro en línea
http://becarios.computo-cientifico.unam.mx
Del 5 al 22 de febrero.
Examen de selección
25 de febrero.
PLATICAS INFORMATIVAS: 14, 18, 19 y 21 de febrero. 12:30 y 18:30 hrs.
En el Auditorio de la DGSCA
http://becarios.computo-cientifico.unam.mx
Inicio
• 24 de marzo de 2008.
martes, 29 de enero de 2008
archivos RWF > 500 GBytes
Estimados usuarios de la supercomputadora KanBalam,
este mensaje es con relación a los archivos RWF, generados por la aplicación Gaussian.
Algunos jobs generan archivos RWF de tamaños entre 500 GB y 2 TB. Dado que los dispositivos de almacenamiento del sistema de archivos tienen una capacidad individual de 2 TB, estos RWFs pueden saturarlos. La mejor manera de evitar esta saturación sin impacto en el rendimiento es partir un RWF grande en varios archivos pequeños. Esto puede hacerse con una línea similar a la siguiente en el archivo de entrada:
%RWF=cuo-1,200GB,cuo-2,200GB,cuo-3,200GB,cuo-4,200GB,cuo-5,200GB,cuo-6,200GB,cuo-7,200GB,cuo-8,200GB,cuo-9,200GB,cuo-10,200GB
en este ejemplo, cada archivo (cuo-*) tiene un tamaño máximo de 200GB, y se pueden generar hasta 10 archivos (2 TB). Estos archivos se generan en el directorio de scratch (GAUSS_SCRDIR) y es importante recordar que, al ser nombrados, NO son eliminados automáticamente al finalizar el job, por lo que les pedimos no olvidar hacerlo manualmente.
A su vez, a partir del próximo lunes 4 de febrero, implementaremos para los archivos RWF la misma política que para los archivos core: serán eliminados después de 7 días de no haber sido utilizados.
Como siempre, estamos a sus órdenes para cualquier duda,
Atentamente
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
www.super.unam.mx
este mensaje es con relación a los archivos RWF, generados por la aplicación Gaussian.
Algunos jobs generan archivos RWF de tamaños entre 500 GB y 2 TB. Dado que los dispositivos de almacenamiento del sistema de archivos tienen una capacidad individual de 2 TB, estos RWFs pueden saturarlos. La mejor manera de evitar esta saturación sin impacto en el rendimiento es partir un RWF grande en varios archivos pequeños. Esto puede hacerse con una línea similar a la siguiente en el archivo de entrada:
%RWF=cuo-1,200GB,cuo-2,200GB,cuo-3,200GB,cuo-4,200GB,cuo-5,200GB,cuo-6,200GB,cuo-7,200GB,cuo-8,200GB,cuo-9,200GB,cuo-10,200GB
en este ejemplo, cada archivo (cuo-*) tiene un tamaño máximo de 200GB, y se pueden generar hasta 10 archivos (2 TB). Estos archivos se generan en el directorio de scratch (GAUSS_SCRDIR) y es importante recordar que, al ser nombrados, NO son eliminados automáticamente al finalizar el job, por lo que les pedimos no olvidar hacerlo manualmente.
A su vez, a partir del próximo lunes 4 de febrero, implementaremos para los archivos RWF la misma política que para los archivos core: serán eliminados después de 7 días de no haber sido utilizados.
Como siempre, estamos a sus órdenes para cualquier duda,
Atentamente
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
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lunes, 28 de enero de 2008
Scalapack en KanBalam
Estimados usuarios de la supercomputadora KanBalam,
para informarles que la biblioteca Scalapack está instalada en la máquina.
Scalapack es una implementación paralela de una buena parte de la biblioteca LAPACK, que contiene funciones para álgebra de matrices, sistemas de ecuaciones, valores propios, valores singulares, entre otras.
Pueden encontrar más información sobre Scalapack en http://www.netlib.org/scalapack
También pueden encontrar un manual de uso, y pruebas de rendimiento en KanBalam en la sección de manuales de la página de supercómputo
Atentamente,
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
www.super.unam.mx
para informarles que la biblioteca Scalapack está instalada en la máquina.
Scalapack es una implementación paralela de una buena parte de la biblioteca LAPACK, que contiene funciones para álgebra de matrices, sistemas de ecuaciones, valores propios, valores singulares, entre otras.
Pueden encontrar más información sobre Scalapack en http://www.netlib.org/scalapack
También pueden encontrar un manual de uso, y pruebas de rendimiento en KanBalam en la sección de manuales de la página de supercómputo
Atentamente,
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
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viernes, 14 de diciembre de 2007
CFITSIO
Estimados usuarios de la supercomputadora KanBalam,
la biblioteca CFITSIO ha sido agregada a las bibliotecas del sistema.
CFITSIO es una biblioteca para leer/escribir archivos en el formato FITS (Flexible Image Transport System).
Pueden encontrar más información sobre esta biblioteca en
http://heasarc.gsfc.nasa.gov/docs/software/fitsio/fitsio.html
Para utilizarla en kanbalam, basta con agregar las líneas -lcfitsio -lm a su línea de compilación, independientemente de qué compilador estén utilizando. Por ejemplo,
% gcc test-cfitsio.c -lcfitsio -lm
% g77 cfitsio.f -lcfitsio -lm
% icc test-cfitsio.c -lm -lcfitsio
% ifort cfitsio.f -lcfitsio -lm
% pathcc test-cfitsio.c -lcfitsio -lm
% pathf90 cfitsio.f -lcfitsio -lm
Atentamente,
Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
la biblioteca CFITSIO ha sido agregada a las bibliotecas del sistema.
CFITSIO es una biblioteca para leer/escribir archivos en el formato FITS (Flexible Image Transport System).
Pueden encontrar más información sobre esta biblioteca en
http://heasarc.gsfc.nasa.gov/docs/software/fitsio/fitsio.html
Para utilizarla en kanbalam, basta con agregar las líneas -lcfitsio -lm a su línea de compilación, independientemente de qué compilador estén utilizando. Por ejemplo,
% gcc test-cfitsio.c -lcfitsio -lm
% g77 cfitsio.f -lcfitsio -lm
% icc test-cfitsio.c -lm -lcfitsio
% ifort cfitsio.f -lcfitsio -lm
% pathcc test-cfitsio.c -lcfitsio -lm
% pathf90 cfitsio.f -lcfitsio -lm
Atentamente,
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