martes, 29 de enero de 2008

archivos RWF > 500 GBytes

Estimados usuarios de la supercomputadora KanBalam,

este mensaje es con relación a los archivos RWF, generados por la aplicación Gaussian.


Algunos jobs generan archivos RWF de tamaños entre 500 GB y 2 TB. Dado que los dispositivos de almacenamiento del sistema de archivos tienen una capacidad individual de 2 TB, estos RWFs pueden saturarlos. La mejor manera de evitar esta saturación sin impacto en el rendimiento es partir un RWF grande en varios archivos pequeños. Esto puede hacerse con una línea similar a la siguiente en el archivo de entrada:

%RWF=cuo-1,200GB,cuo-2,200GB,cuo-3,200GB,cuo-4,200GB,cuo-5,200GB,cuo-6,200GB,cuo-7,200GB,cuo-8,200GB,cuo-9,200GB,cuo-10,200GB

en este ejemplo, cada archivo (cuo-*) tiene un tamaño máximo de 200GB, y se pueden generar hasta 10 archivos (2 TB). Estos archivos se generan en el directorio de scratch (GAUSS_SCRDIR) y es importante recordar que, al ser nombrados, NO son eliminados automáticamente al finalizar el job, por lo que les pedimos no olvidar hacerlo manualmente.

A su vez, a partir del próximo lunes 4 de febrero, implementaremos para los archivos RWF la misma política que para los archivos core: serán eliminados después de 7 días de no haber sido utilizados.

Como siempre, estamos a sus órdenes para cualquier duda,

Atentamente

Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
www.super.unam.mx

lunes, 28 de enero de 2008

Scalapack en KanBalam

Estimados usuarios de la supercomputadora KanBalam,

para informarles que la biblioteca Scalapack está instalada en la máquina.

Scalapack es una implementación paralela de una buena parte de la biblioteca LAPACK, que contiene funciones para álgebra de matrices, sistemas de ecuaciones, valores propios, valores singulares, entre otras.

Pueden encontrar más información sobre Scalapack en http://www.netlib.org/scalapack

También pueden encontrar un manual de uso, y pruebas de rendimiento en KanBalam en la sección de manuales de la página de supercómputo

Atentamente,

Departamento de Supercómputo
DGSCA - UNAM
www.super.unam.mx